Ассамблея является объединением представителей национальных организаций Курганской области.
В 2000 году по инициативе национально-культурных организаций и при содействии Правительства области был созван учредительный съезд народов Зауралья, на котором создана общественная организация «Ассамблея народов Зауралья», которая является региональным отделением «Ассамблеи народов России» (общероссийская общественная организация, объединяющая представителей более 160 народов).
Ассамблея объединяет основные этнокультурные общества, включая центры культур русских, украинцев, немцев, азербайджанцев, организации белорусов, казахов, татар, башкир, чеченцев и ингушей. За время своего существования «Ассамблея народов Зауралья» стала серьезным институтом гражданского общества, который выступает как настоящий межэтнический общественный парламент для обсуждения и решения проблем в социальной, национальной и культурной сферах. Круг вопросов, которые решает Ассамблея, достаточно широк: вопросы национально-культурного развития русского народа, сохранения и развития русского языка; мониторинг состояния межэтнических отношений; участие национальных организаций и центров в работе по профилактике безнадзорности детей и правонарушений несовершеннолетних; участие в организации и проведении межнациональных мероприятий — фестивалей, встреч, «круглых столов», традиционных национальных праздников.
Специфична организация работы постоянного органа управления — Совета Ассамблеи: часто его заседания проводятся совместно с заседаниями Консультативного Совета по проблемам национальных отношений при Губернаторе области. В 2007 году подобное заседание состоялось в г. Далматово на тему «Свято-Успенский Далматовский монастырь – символ мира и сотрудничества славянских и тюркских народов». Монастырь является своеобразным символом мира и сотрудничества славян, башкир и татар. Его основателем был казак Дмитрий Мокринский (мать которого – крещеная татарка), а земли для монастыря передал татарский мурза Илигей Магометов. Члены Советов вместе с представителями Курганской Епархии Русской православной церкви и администрации Далматовского района побывали в монастыре, познакомились с состоянием дел по его реставрации и обсудили вопросы дальнейшего восстановления этого уникального ансамбля церковного зодчества, памятника истории и архитектуры федерального значения.
Практикуются также выездные заседания Совета в городах и районах Курганской области с посещением местных учреждений культуры, школ, которыми накоплен интересный опыт работы по возрождению, сохранению традиционной культуры народов. В 2009 году прошло совместное заседание Президиума Совета «Ассамблеи народов Зауралья», Совета Общественной палаты Курганской области и Совета по взаимодействию с религиозными объединениями при Губернаторе Курганской области на тему «О преодолении психологии нетерпимости, ксенофобии и экстремизма в этноконфессиональной среде Курганской области».
Ассамблея принимала активное участие в формировании Общественной палаты Курганской области (её представитель входит в состав Палаты). Большой интерес населения вызывают проводимые с участием «Ассамблеи народов Зауралья» Дни славянской письменности и культуры в, традиционные национальные праздники «Сабантуй», «Навруз» и др. В 2007 году в Половинском районе по инициативе «Ассамблеи народов Зауралья» проведен праздник представителей различных национальностей, которые проживают на территории Зауралья. Губернатор Курганской области поддержал эту инициативу и издал соответствующее распоряжение.
Ассамблея работала над реализацией на территории области Федеральной целевой программы «Формирование установок толерантного сознания и профилактика экстремизма в российском обществе», принимала участие в организации и проведении круглых столов по данной проблеме, межрегиональной научной конференции «Толерантность в культуре, этнических и межконфессиональных отношениях».
Ассамблея установила и расширяет международные контакты, например, с аналогичными структурами Республики Казахстан. В 2008 году был подписан меморандум о сотрудничестве между Ассамблеей народа Казахстана Костанайской области и «Ассамблеей народов Зауралья». В 2009 году подписано соглашение о сотрудничестве между «Ассамблеей народов Зауралья» и Северо-Казахстанской Ассамблеей народа Казахстана.